第二军医大学长征医院肿瘤科成立于1994年，建科十余年来，肿瘤科全科医护人员在学科带头人王杰军教授的带领下，坚持求实创新、开拓进取的指导思想，不断探索总结，逐渐在学科建设方面打下了坚实的基础并迅速成长壮大，在医疗、科研以及教学等方面逐步形成了自己的学科优势和特色，并取得良好的社会效益。
医疗方面，第二军医大学长征医院肿瘤科始终追踪当前肿瘤研究的较新动态和治疗理念，并尽少有努力将其应用到自身的医疗实践中来，逐渐形成了自己的医疗特色，主要表现在以下几个方面：
（1）胃肠肿瘤。胃肠肿瘤是我国最常见的恶性肿瘤，危害极其严重。在我科以往胃肠肿瘤诊疗优势的基础上，我们紧紧围绕临床实践和学科建设的需要，确立了以胃肠肿瘤为主的研究方向。
在循证医学思维的指导下，与兄弟科室广泛协作，积极开展以手术、放疗、化疗以及生物治疗为主的胃肠肿瘤的综合治疗模式，少有限度地延长胃肠肿瘤患者的生存期和提高胃肠肿瘤患者的生活质量。尤其在胃肠肿瘤的早期诊断、辅助化疗、复发或转移的预测、姑息化疗以及生物治疗等方面，积累了丰富的专科经验，制订了严格的诊疗操作规范，不断提升胃肠肿瘤的诊疗水平。
（2）姑息治疗。晚期恶性肿瘤患者病情错综复杂，治疗困难，但我们有针对性地积极控制和改善肿瘤相关疼痛、贫血、疲劳等症状和体征，对肿瘤患者的情绪障碍予以专业的心理辅导和治疗，以期少有限度地提高患者的生活质量，并对其家庭予以必要的人文支持。
（3）微创治疗。在开展常规治疗的同时，我们对不能根治的晚期肿瘤患者积极探索肿瘤的微创治疗。目前已成功开展了氩氦冷冻、放射性粒子植入以及热疗等治疗项目，积累了丰富的治疗经验。
科研方面，第二军医大学长征医院肿瘤科依托大学优势，积极开展科研工作。经过多年的努力和积累，目前已在肿瘤转移的基础与临床、姑息治疗、胃癌的预防和综合治疗等方面取得了可喜的成果。
近年来主编参编专著5部，发表科研论文60余篇，其中SCI收录3篇。先后获得国家自然科学基金、国家“863”计划、国家科技支撑计划、上海市个性学科带头人计划、上海市科学基金等11项基金资助，科研经费300余万元。获得军队科技进步一等奖1项，军队医疗成果二等奖、三等奖各1项。
作为卫生部指定的肿瘤药物临床药理研究基地，长征医院肿瘤科每年还承担着大量的抗肿瘤新药的Ⅱ期、Ⅲ期临床试验工作。这不仅有力地促进抗肿瘤新药的科学研究，而且还使很多晚期肿瘤患者有机会接受较新的药物治疗，增加了治疗机会，节省了治疗费用。
教学方面，肿瘤科以研究生、进修生和实习生的培养和训练作为教学工作重点。目前学科拥有国务院学位委员会批准的博士、硕士学位授予权，有博士研究生导师1名，硕士研究生导师1名。
自1996年来，该学科已有7人获得博士学位，12人获得硕士学位，现已成为各自岗位上的业务骨干。同时，基于肿瘤研究的国内外趋势，肿瘤科还在本科教育阶段积极开展《肿瘤学》选修课的课堂教学试点，努力探索肿瘤学本科教育的可行性。